In 1990 is het project gestart in het centrum voor Huisartsengeneeskunde van de KU Leuven. De bedoeling was om een grote database op te bouwen op de morbiditeit in de eerste lijnszorg. De data moesten informatie over de incidentie en prevalentie van ziekten in Vlaanderen aanbieden aan onderzoekers.
Vandaag, anno 2017 wordt Intego nog steeds gefinancierd door de Vlaamse Gemeenschap en omvat een netwerk van meer dan 100 huisartsen werkzaam in ongeveer 50 huisartsenpraktijken en verspreid over heel Vlaanderen. Jaarlijks worden de data opgehaald in de huisartsenpraktijken en staan ze ter beschikking van onderzoekers aan de verschillende universiteiten, masterstudenten en eenieder die denkt de data nuttig te kunnen gebruiken.